Bộ phận ắc quy xe Janus có chức năng cung cấp nguồn điện để xe khởi động bằng nút đề. Ngoài ra, ắc quy còn cấp điện cho hệ thống Fi, hệ thống nhiên liệu, hệ thống điện nổ và các thiết bị điện trên xe.
Khi chọn ắc quy cho xe Janus, bạn có thể chọn bình có dung lượng 4Ah, điện áp 12V và kích thước 113 x 70 x 105 mm. Loại bình này có dung tích khá ít, chỉ có thể cập được nguồn điện nhỏ cho xe.
Bên cạnh ắc quy nguyên bản, bạn có thể lựa chọn bình có dung lượng 5Ah hoặc 6 Ah. Tuy nhiên cần tìm bình có kích thước chuẩn như trên để có thể lắp vừa vị trí bình trên xe.

GS là dòng ắc quy chì axit của thương hiệu Nhật Bản, được Yamaha lắp cho nhiều dòng xe xuất xưởng. Loại ắc quy này có thiết kế an toàn, chống rò rỉ điện và có giá thành phù hợp với đa số người dùng.
Globe là hãng ắc quy thương hiệu Đài Loan lớn nhất thế giới. Ắc quy Globe có đầy đủ cả 3 loại 4 Ah, 5 Ah, 6Ah phù hợp cho xe Janus. Loại ắc quy này nổi bật với nguồn điện ổn định và chế độ bảo hành tốt.
Lithium là loại ắc quy cao cấp, sử dụng pin Lithium nên rất thân thiện với môi trường. Bình ắc quy này có điện áp cao, khả năng nạp xả điện mạnh mẽ, rất an toàn cho người dùng và đặc biệt có độ bền cao, tuổi thọ từ 6 - 8 năm.
Khi cảm thấy bình ắc quy yếu điện, không thể khởi động xe Janus và kiểm tra thấy ắc quy không thể nạp xả được thì cần thay mới.
Theo khuyến cáo của Yamaha, với bình ắc quy nguyên bản thì nên thay mới sau 2 năm chạy xe. Tuy nhiên, các bình ắc quy chì axit thường có độ bền thực tế cao hơn, có thể sử dụng từ 3 - 4 năm.